Loja se encuentra a una altitud de 2.100 metros sobre el nivel del mar en el valle de Cuxibamba, con un clima de eterna primavera durante todo el año, aunque la mejor época es de octubre a enero. Las temperaturas fluctúan entre 16° C (60o F) y 21º C (70º F), con una temperatura diaria promedio de 17º C (63º F). Los meses de febrero a mayo son más húmedos que el resto del año.
