Su economía se basa en la minería, el comercio, el turismo y la agricultura. Las mayores industrias de la provincia están conformadas por la minera, la maderera y la agrícola (piscicultura, avicultura, etc.). Las selvas zamoranas son cuna de la nacionalidad indígena shuar. Sus ríos son caudalosos y desembocan en el río Amazonas, los principales son: Zamora, cuyos orígenes están en la provincia de Loja; los ríos Chinchipe, Yacuambi y Nangaritza, entre otros.
En la Provincia de Zamora Chichipe la riqueza de fauna y flora es notable debido a su posición geográfica en el piedemonte amazónico lo que ha generado una inmensurable y desconocida biodiversidad con un alto grado de endemismo que se puede apreciar especialmente en varias zonas de la provincia.
La fauna se compone de mamíferos como: pumas, jaguares, tigrillos, osos de anteojos, dantas, ciervos de cola blanca, lobos andinos, lobos de río, capibaras, pacas, agutís, armadillos, coatíes, pecaríes y una diversidad de monos, entre otros.
También hay numerosas clases de anfibios y reptiles, en las que se destacan las ranas y serpientes como: boa, anaconda, coral, equis, macanche, hoja podrida, yamunga, entre otras. La fauna de peces en sus ríos incluyen: bagre, zumba, anguila, corroncho, tilapia, trucha, bocachico, blanco, guancha, vieja, sabina, entre otros.
El aprovechamiento del medio natural aporta para cautivar a los turistas, siguiendo el curso de los ríos, es importante para la economía de la provincia. Los grupos de turistas pueden disfrutar de los hermosos paisajes selváticos en el Parque Nacional Podocarpus, donde se encuentran cascadas y ríos libres de la contaminación, lagunas y cañones. Además de su extensa fauna como los gallitos de la peña, trogones, tucanes de altura, etc.
